Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms