Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HJURPQ8NCD3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms