Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms