Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms