Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRELID2Q8N945 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRELID2Q8N945 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRELID2Q8N945 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRELID2Q8N945 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID2Q8N945 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID2Q8N945 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms