Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf54Q8N8G6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf54Q8N8G6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf54Q8N8G6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf54Q8N8G6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C15orf54Q8N8G6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms