Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBR7Q8N806 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms