Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF1Q8N6C5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms