Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLASRPQ8N2M8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLASRPQ8N2M8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms