Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PASD1Q8IV76 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms