Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms