Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM220AQ7Z4H9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM220AQ7Z4H9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms