Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms