Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDXQ7Z353 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms