Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF23Q7RTU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF23Q7RTU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF23Q7RTU1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCF23Q7RTU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms