Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP43Q70EL4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP43Q70EL4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP43Q70EL4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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USP43Q70EL4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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USP43Q70EL4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP43Q70EL4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
USP43Q70EL4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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