Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms