Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN12Q6ZSI9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN12Q6ZSI9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms