Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFXL1Q6ZNB6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFXL1Q6ZNB6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms