Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMD1Q6SPF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMD1Q6SPF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms