Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM88Q6PEY1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM88Q6PEY1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms