Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKN3Q6P5Z2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKN3Q6P5Z2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms