Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SFXN4Q6P4A7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFXN4Q6P4A7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFXN4Q6P4A7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFXN4Q6P4A7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms