Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP5Q6NZY7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms