Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54Q6NXT1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms