Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms