Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWSAP1Q6NVH7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SWSAP1Q6NVH7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms