Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NANOGP8Q6NSW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms