Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL2Q6F5E8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms