Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCTP1Q6DN14 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms