Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD16Q68DU8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD16Q68DU8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms