Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LARP1BQ659C4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARP1BQ659C4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms