Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM1

AFMID, Kynurenine formamidase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMIDQ63HM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMIDQ63HM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFMIDQ63HM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms