Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALS2CLQ60I27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CLQ60I27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms