Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR78Q5VTH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms