Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GKAP1Q5VSY0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms