Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRIP1Q5VSL9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms