Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
L1TD1Q5T7N2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1TD1Q5T7N2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1TD1Q5T7N2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1TD1Q5T7N2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
L1TD1Q5T7N2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms