Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD3Q5T447 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms