Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1BQ5T0F9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D1BQ5T0F9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms