Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms