Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VARS2Q5ST30 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VARS2Q5ST30 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms