Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms