Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAT1Q5SQI0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATAT1Q5SQI0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAT1Q5SQI0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms