Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SAMD9Q5K651 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SAMD9Q5K651 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms