Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNT1Q5JUK3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms