Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms