Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSD17B12Q53GQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms