Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 787.5 ms