Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF260Q3ZCT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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