Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC27Q2M243 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC27Q2M243 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms